Phylogenomics suggests oxygen availability as a driving force in Thaumarchaeota evolution 

https://www.nature.com/articles/s41396-019-0418-8

Thaumarchaeota phylum is an archaea group with the ability to inhabit a large number of ecosystems both terrestrial and marine. Also, all Ammonia-Oxidizing Archea (AOA) members belong to this group. AOA is a very important group due to its fundamental role in the biochemical nitrogen cycle. Despite its importance, the Thaumarchaeota evolution study has been approached in an inappropriate way. Here, the researchers aim is to obtain a deeper vision of the thaumarchaeota evolution through a phylogenetic tree with phylogenetically and ecologically diverse lineages sequences, and evaluate the impact of lateral gene transfer (LGT) from bacteria to Thaumarchaeota like a motor adaptation. Their results were: i) The Thaumarchaeota phylogenetic tree showed three sequential evolution events, the transformation from no-AOA to AOA, shallow ocean colonization of AOA, and its expansion to the deep ocean, which coincided with the planet Great Oxygenation Event (GOE), and oxygenation of the shallow and deep ocean, respectively, and ii) Although LGT events from bacteria to archaea were reported in previous studies to be essential for the transformation of No-AOA into AOA, their results indicated that they are less important than previously thought.

Ren, M., Feng, X., Huang, Y., Wang, H., Hu, Z., Clingenpeel, S., ... & Hollibaugh, J. T. (2019). Phylogenomics suggests oxygen availability as a driving force in Thaumarchaeota evolution. The ISME journal, 13(9), 2150-2161.

Nitrogen fixation in a landrace of maize is supported by a mucilage-associated diazotrophic microbiota

https://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.2006352

The association of microorganisms with plants provides different benefits, such as improvements in plant development and defense, and the acquisition of nutrients. In the Sierra Mixe of Oaxaca, a variety of maize has been cultivated with little or no fertilizers for hundreds of years. Since Mexico is the place of origin of this cereal, it has been hypothesized that this variety possesses a unique nitrogen-fixing microbial community that is not found in modern cultivated maize. Interestingly, this variety's aerial roots produce large amounts of mucilage, providing an optimal environment for bacteria. To understand the role of aerial roots and the mucilage in Sierra Mixe Maize, the microbial communities associated with the mucilage and from plant tissues were characterized using metagenomic analysis. Next, acetylene reduction and 15N incorporation assays were performed in greenhouse and field tests. Their results revealed that Sierra Mixe Maize could acquire and incorporate nitrogen from the atmosphere, probably through a complex nitrogen-fixing microbial community supported through the aerial roots mucilage chemical and physical characteristics.

Van Deynze, A., Zamora, P., Delaux, P. M., Heitmann, C., Jayaraman, D., Rajasekar, S., ... & Berry, A. M. (2018). Nitrogen fixation in a landrace of maize is supported by a mucilage-associated diazotrophic microbiota. PLoS biology, 16(8), e2006352.

https://bluejeans.com/726213803

Para seguir el seminario por teléfono móvil o equipo de cómputo, favor de seguir la liga donde dice: Lugar.

Iniciamos con el ciclo de seminarios de artículos de biomedicina y bionanotecnología. Cada estudiante de la nueva generación presentará un artículo a la semana para promover la discusión científica, y será evaluado por sus pares.

Comité Evaluador:

Gabriela Carballo López, estudiante de maestría

Melissa I. Gutiérrez Araujo, estudiante de maestría

Kee W. L. Dan Ávila, estudiante de doctorado

Enlace calendario

https://docs.google.com/document/d/1Gm7dx8iJhh7NomNRRGkXIaItc1k5f96uiw75VjGBVs0/edit?usp=sharing 

Para seguir el seminario por teléfono móvil o equipo de cómputo, favor de seguir la liga donde dice: Lugar.

La enfermedad vascular cerebral (EVC) es una de las principales causas de discapacidad y muerte a nivel mundial. La EVC de tipo isquémica, caracterizada por la oclusión transitoria o prolongada (isquemia cerebral aguda, ICA) de los vasos sanguíneos que suministran sangre al cerebro, siendo esta la más prevalente. El tratamiento canónico para la ICA es la trombólisis con el activador tisular de plasminógeno (rtPA) solo o en combinación con la terapia endovascular, sin embargo, para obtener los mejores resultados el tiempo de administración del rtPA no debe ser mayor de 4.5 horas después de la aparición de los síntomas. En este sentido el diagnóstico, realizado principalmente a través de imagenología (tomografía computarizada o resonancia magnética), juega un papel fundamental para que el clínico tome la decisión sobre el tratamiento que debe recibir el individuo con ICA, sin embargo, en la mayoría de las unidades clínicas no es viable tener acceso a este tipo de tecnologías, por lo que la ventana para administrar el rtPA se hace más estrecha lo que repercute negativamente en el desenlace de los individuos con ICA. Debido a lo anterior diversos estudios se han enfocado en identificar nuevas estrategias moleculares para diagnosticar de manera oportuna y eficiente la ICA. En este contexto en el seminario hablaré sobre los microRNAs o miRNAs como potenciales biomarcadores para el diagnóstico temprano de la ICA, resaltando la importancia de realizar estudios sobre la expresión diferencial de miRNAs en individuos mexicanos con este padecimiento.

https://bluejeans.com/790879062?src=textEmail

Las pinzas ópticas, que permiten confinar objetos tridimensionalmente mediante un solo haz de luz fuertemente enfocado, fueron desarrolladas en 1986 por Arthur Ashkin y su equipo. Las trampas acústicas, por otro lado, tienen las mismas bases físicas que las trampas ópticas, sin embargo, el análogo de la trampa de un solo haz o “pinzas acústicas” se logró tan solo en 2016. ¿Por qué tuvieron que transcurrir tres décadas para un desarrollo que se antojaba tan inmediato? En el seminario se dará respuesta a esta pregunta y se explorará, a través de analogías y diferencias entre óptica y acústica, un área que guarda una cercana relación con ambos tipos de trampas: los campos ondulatorios estructurados.

Hora: 12 horas (hora del centro)