En este departamento se estudia el medio marino como un sistema físico. La misión del departamento es investigar la física del océano en general y de los mares mexicanos en particular, mediante proyectos directamente desarrollados por miembros del personal académico, así como a través de la formación de recursos humanos a través de los tres niveles profesionales; es decir, mediante dirección de tesis de licenciatura y por medio de los programas de maestría y doctorado.

Cavazos Pérez María Tereza Estrada Allis Sheila Natali Gómez Valdés José Graef Ziehl Federico López Mariscal Juan Manuel Magar Brunner Vanesa Marinone Moschetto Silvio Guido Lorenzo Ocampo Torres Francisco Javier Ortiz Figueroa Modesto Pallàs Sanz Enric Parés Sierra Alejandro Francisco Pavía López Edgar Gerardo Pérez Brunius Paula Ramírez Aguilar María Isabel Ramírez Mendoza Rafael Reyes Coca Sergio Sheinbaum Pardo Julio Turrent Thompson Cuauhtémoc Velasco Fuentes Oscar Uriel Zavala Sansón Luis